Notre offre

L'EPGV dispose de technologies de pointe permettant d'analyser avec précision la diversité génétique des plantes et animaux. 

Notre plateforme propose:

• Le séquençage haut débit (NGS) courtes lectures avec les systèmes Illumina Miseq, NovaSeq6000 et NovaSeqX+ 
• Le séquençage haut débit (NGS) courtes lectures avec le système MGI G400

• Le séquençage haut débit (NGS) longues lectures Hifi sur le PacBio REVIO

• Le séquençage haut débit (NGS) longues lectures Nanopore sur le minION / gridION et promethION
• L'enrichissement de régions cibles et leur séquençage par NAS (Nanopore Adaptive Sampling)

• Des outils de génotypage par capture (technologie NEBnext Direct Genotyping Solution) et par extension d'amorce (technologie TECAN Allegro targeted Genotyping V2)

• Une infrastructure robuste pour le traitement des données massives :
  • un cluster HPC (86 noeuds, 2536 coeurs, 8 à 107 Go /coeur)
  • un robot d'archivage pour la sécurisation des données de séquençage

Ces technologies permettent à l'EPGV de rester à la pointe de la recherche en génomique végétale, offrant à nos partenaires les moyens d'explorer la diversité intra- et inter- spécifique et de développer de nouvelles variétés adaptées aux défis agronomiques contemporains.