4 génomes de lin fibre

Le projet GENOFLAX génère 4 génomes de référence pour le lin !

Le premier article scientifique issu du projet GENOFLAX est publié !

La collaboration entre l'EPGV, Arvalis et Linéa a permis le séquençage, l'assemblage et l'annotation de 4 génomes de lin "fibre" (Linum usitatissimum) des groupes génétiques européens, utilisés en amélioration variétale.

Impliqué dès le montage du projet, l'EPGV a fait bénéficier le projet de son expertise en séquençage Nanopore pour l'assemblage de génomes. Ces génomes posent les fondations d'une analyse plus large en cours visant à déterminer la structuration fine des variétés disponibles dans les collections. Afin de caractériser cette diversité, l'EPGV a développé un outil de génotypage basé sur la technologie Allegro® (Tecan) pour mobiliser cette diversité, afin de produire de nouvelles variétés plus adaptées aux changements globaux.